Der Angreifer hat sich beim 1:1 gegen die TSG Hoffenheim eine Muskelverletzung in der Wade zugezogen.
"Er wird erst nach der Länderspielpause, vielleicht sogar erst Ende November wieder ein Kandidat für den Kader sein", sagte Kohfeldt.
Füllkrug hat in dieser Saison vier der bisherigen sieben Werder-Tore in der Bundesliga erzielt. In der Vorsaison war der Stürmer nach einem Kreuzbandriss monatelang ausgefallen.