Der 24-Jährige hatte sich in der vergangenen Woche in der Vorbereitung der deutschen Nationalmannschaft auf das EM-Qualifikationsspiel in Hamburg gegen die Niederlande (2:4) erneut am linken Oberschenkel verletzt.
Über die voraussichtliche Dauer des Ausfalls von Goretzka machte der FC Bayern keine Angaben.