Damit muss die in Tokio an Nummer eins gesetzte Kerber weiter auf ihren ersten Turniersieg in diesem Jahr warten.
"Es war ein ziemlich hartes Match", sagte Kerber: "Wir haben beide toll gespielt, aber Ana hat in den entscheidenden Momenten zugeschlagen."
Die an Nummer drei gesetzte Ivanovic, die von bisher sieben Matches gegen Kerber mittlerweile fünf gewonnen hat, trifft im Finale von Tokio auf die frühere Weltranglistenerste Caroline Wozniacki. Die an Nummer zwei gesetzte Dänin gewann ihr Halbfinale gegen die Spanierin Garbine Muguruza mit 6:4, 2:6, 6:2.
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