Vor 11.314 Zuschauern in der Prager Axa-Arena trafen Libor Sionko in der 61. und 84. Minute sowie der eingewechselte Verteidiger Michal Kadlec (89.). Schottland kam durch David Clarkson (85.) zum Ehrentreffer.
Matchwinner Sionko, der beim FC Kopenhagen unter Vertrag steht, konnte sich als offensiver Mittelfeldspieler mit seinen zwei Toren als Vertretung für den verletzten Kapitän Tomas Rosicky empfehlen.
Koller bleibt blass
Der neue tschechische Kapitän Tomas Ujfalusi fiel in der Defensive durch einige harte Einsätze auf. Mittelstürmer Jan Koller vom 1. FC Nürnberg, nominell einzige Spitze, konnte bis zu seiner Auswechslung zur Halbzeit zwei Kopfballchancen nicht nutzen.
Tschechien und die gastgebende Schweiz eröffnen am 7. Juni die EM. Schottland war in der EM-Qualifikation knapp an Italien und Frankreich gescheitert.