Der 35-Jährige verlässt damit den Bundesligisten noch vor der am Freitag beginnenden Rückrunden-Vorbereitung.
"Wollten ihn nicht im Ungewissen lassen"
Nach einem Muskelfaserriss im Oberschenkel hatte Baumgart in der Hinrunde der laufenden Saison nicht mehr den Sprung in den Erstliga-Kader geschafft.
Der Stürmer war im Sommer 2004 vom 1. FC Union Berlin nach Cottbus gewechselt.
"Wir haben die Gespräche zur Vertragsauflösung gesucht, weil wir ihn gerade wegen seiner Verdienste für den FC Energie nicht im Ungewissen lassen wollten", sagte Manager Steffen Heidrich über die "fairen Gespräche. Es ist wichtig, dass alle Seiten Klarheit haben."