Janeschitz war seit 2009 im ÖFB unter anderem als Leiter der Traineraus- und -fortbildung sowie als Nachwuchs-Teamchef tätig. Mit dem Engagement von Koller im November 2011 übte er zusätzlich zur Trainerausbildung die Tätigkeit des Assistenztrainers des Nationalteams aus, ehe er sich ab 2016 ausschließlich auf das A-Team konzentrierte.
Janeschitz sprach in einer Aussendung von "erfolgreichen und ereignisreichen Jahren, in denen ich mich als Persönlichkeit weiterentwickeln konnte". Für die kommenden Herausforderungen könne er viel mitnehmen. Bernhard Neuhold, Geschäftsführer der ÖFB Wirtschaftsbetriebe GmbH, dankte für die geleistete Arbeit: "Thomas Janeschitz hat sich im ÖFB in den vergangenen Jahren mit seiner besonnenen und analytischen Art in vielen wichtigen Aufgabengebieten eingebracht."
